子どもたちの学ぶ意欲を育て、引きだし、伸ばしていくことを大切にしています。そのために、教師はカリキュラムや教科の研究につとめています。国語・算数・社会・生活は学級担任が、理科・英語・音楽・体育・図工・家庭科・聖書の授業は教科専任の教師が行います。経験豊かな教師が教材の開発にも携わり、日々の授業に工夫を凝らしながら一貫性のある指導を行っています。

土の校庭で教師も子どもたちと共に遊び、子どもたちの元気な笑顔を大切にしています。子どもは遊びを通じ、自然のすばらしさ、集団のルール、豊かな人間関係など様々なことを学びます。 休み時間や放課後の時間を大切にすることはもちろん、校内行事や校外学習、宿泊行事を工夫し、遊びを通して学べる環境を整えています。

毎日の礼拝で自分たちが神様に愛されていることを感じ、その愛への感謝をあらわします。そして同じように愛されている「隣り人」である友だちを大切に学校生活を送ります。楽しく心豊かな一日は、朝の礼拝によって形成されています。

学校法人聖学院は幼稚園から大学院まで備わっているプロテスタントのキリスト教に基づく一貫教育機関です。 聖学院小学校は、 100年の長い歴史と伝統を持つ女子聖学院を母体として、 1960年（昭和35年）、女子聖学院小学部として創立され、 1966年（昭和41年）、法人組織の変更に伴い、 聖学院小学校となりました。創立以来、一貫してキリスト教の信仰に基づく教育を続けている男女共学の小学校です。